Nabala mõisat mainiti esimest korda 1510. aastal, kui see kuulus Tallinna Mihkli tsistertslaste nunnakloostrile; tollal oli see arvatavasti kindlustatud kivihoone ehk väikelinnus. Hiljem kuulus Nabala Eestimaa rüütelkonnale ning Nabala ja Pääbo kõrvalmõisa tulu läks peamiselt rüütelkonna maanõunike kolleegiumile. Tänini säilinud ühekorruseline kivist peahoone ehitati arvatavasti 19. sajandil.
